Spesifikasi mesin pencincang sisa perubatan bergantung terutamanya pada kapasiti pemprosesannya dan senario yang berkenaan. Mesin pencincang kecil biasanya direka dengan kapasiti pemprosesan harian sekitar 50–200 kg, sesuai untuk hospital komuniti, klinik dan makmal; peralatan bersaiz sederhana dan besar boleh memproses sehingga 500 kg hingga beberapa tan, sesuai untuk institusi perubatan besar atau pusat rawatan sisa perubatan berpusat. Kapasiti pemprosesan yang berbeza akan menghasilkan variasi yang sepadan dalam saiz, berat dan kuasa peralatan.
Dari segi spesifikasi struktur, ruang pengisar mesin pencincang dan reka bentuk bilah juga merupakan petunjuk utama. Bilangan bilah, jenis bilah, kelajuan putaran, dan saiz zarah keluaran semuanya secara langsung mempengaruhi kesan carik. Peralatan berspesifikasi tinggi biasanya menggunakan reka bentuk putaran berbilang bilah, berkelajuan tinggi, yang mampu memproses pelbagai sisa perubatan seperti picagari, tiub infusi dan botol ubat, sambil memastikan carik seragam untuk pensterilan seterusnya. Spesifikasi sistem elektrik dan tambahan juga merupakan parameter penting. Kuasa peralatan, voltan, jenis sistem penghantaran, dan tahap automasi sistem kawalan perlu ditentukan berdasarkan persekitaran operasi dan keperluan beban. Peralatan berspesifikasi tinggi biasanya dilengkapi dengan peranti perlindungan keselamatan, perlindungan beban lampau dan fungsi penutupan automatik untuk memastikan keselamatan pengendali sambil meningkatkan kestabilan dan kebolehpercayaan peralatan.