Pembakaran suhu tinggi adalah salah satu teknologi yang paling biasa digunakan untuk merawat sisa perubatan, sesuai untuk sisa berjangkit, sisa patologi, dan sisa farmaseutikal. Peralatan menjana suhu tinggi (biasanya 800 darjah ~ 1200 darjah ) dalam kebuk pembakaran, mengoksida sepenuhnya dan mengurai bahan organik dalam sisa sambil membunuh mikroorganisma patogen. Peralatan insinerasi moden biasanya dilengkapi dengan kebuk pembakaran sekunder dan peranti penulenan gas serombong untuk membuang gas berbahaya dan bahan zarah, memastikan pelepasan memenuhi piawaian alam sekitar.
Peralatan pensterilan stim tekanan tinggi menggunakan suhu tinggi, stim tekanan tinggi untuk mensterilkan sisa perubatan, biasanya pada 121 darjah ~134 darjah dan 1.2~2.1 MPa untuk tempoh tertentu. Teknologi ini sesuai untuk sisa berjangkit dan beberapa sisa patologi, dan boleh menyahaktifkan bakteria, virus, dan mikroorganisma patogen lain sepenuhnya. Peralatan tersebut biasanya termasuk bekas pensterilan, sistem pemanasan dan sistem kawalan tekanan; sesetengah model juga mempunyai fungsi kacau atau penghancuran automatik untuk meningkatkan kecekapan pemprosesan dan keseragaman pensterilan.
Teknologi pensterilan gelombang mikro menggunakan tenaga gelombang mikro untuk menyebabkan molekul air dalam sisa bergetar pada kelajuan tinggi, menghasilkan haba dan dengan itu membunuh mikroorganisma patogen dalam sisa. Teknologi ini menawarkan kelajuan pemprosesan yang pantas, penggunaan tenaga yang rendah dan pencemaran alam sekitar yang minimum. Peralatan pensterilan gelombang mikro sering dilengkapi dengan alat carik atau pemecah beg untuk memecahkan sisa sebelum dipanaskan, meningkatkan kecekapan pensterilan. Ia sesuai untuk lokasi bersaiz kecil dan sederhana seperti hospital dan pusat kesihatan masyarakat.
Pensterilan kimia melibatkan mencampurkan sisa perubatan dengan pembasmi kuman (seperti klorida dan peroksida) untuk menyahaktifkan mikroorganisma patogen dalam sisa. Kaedah ini biasanya digunakan untuk sisa cecair atau sisa farmaseutikal tertentu. Peralatan biasanya termasuk bekas tindak balas tertutup, sistem kacau dan peranti pelepasan keselamatan untuk mengelakkan kebocoran disinfektan dan pencemaran sekunder.